Die Gemeinde Münchsmünster liegt im Nordosten des Landkreises Pfaffenhofen a.d.Ilm,
Regierungsbezirk Oberbayern, am östlichen Rand der Region 10 - Ingolstadt. Im Süden und Osten grenzt der Regierungsbezirk Niederbayern (Stadt Neustadt und das gemeindefreie Gebiet des Dürnbucher Forstes) an.
Die Gemeinde liegt an der B 16 Ingolstadt - Regensburg und an der Bahnlinie zwischen diesen beiden Städten.
Die noch zum Verdichtungsraum um Ingolstadt zählende Gemeinde liegt an einer Entwicklungsachse von überregionaler Bedeutung (Achse Neu-Ulm - Ingolstadt - Regenburg).
Münchsmünster liegt auf 357 m. ü. NN. Die Gesamtfläche beträgt 1 584 ha.
Verkehrsanbindung:
Flughafen München ca. 70 km
A 93 Siegenburg 17,5 km
A 9 Manching 18,0 km
B 16, B 16a und B 300 auf Gemeindegebiet
Bahnhof Münchsmünster an der Bahnlinie Ingolstadt - Regensburg (Deutsche Bahn)
Die Entfernung zur Autobahn A 9 München-Nürnberg und A 93 Wolnzach-Regensburg beträgt jeweils ca. 20 km.